网站地图 │ 联系我们 │ English │ 中国科学院
首页│机构概况 │机构设置 │研究队伍 │ 科研成果 │国际合作 │ 院地合作 │研究生教育│创新文化 │ 党群园地 │科学传播 │信息公开
站内搜索
研究队伍
·院士专家
·科研项目组
·杰出青年科学基金获得者
·研究员
·正高级工程师
·副研究员
·高级工程师
学术活动
·中泰灵长类生物多样性与健康大数据研讨会 [04.18]
·学术报告-Single Cell Gene Therapy and Analysis on... [04.18]
·北京生科院4月10日第162期精品讲座 [04.08]
·北京生科院4月4日第161期精品讲座 [04.01]
·北京生科院3月21日第160期精品讲座 [03.20]
友情链接
·中国科学院
·中华人民共和国卫生部
·北京市科学技术委员会
·国家自然科学基金委员会
·中华人民共和国科学技术部
您现在的位置:首页 > 研究队伍
百人计划

 

孙英丽 ( SUN Yingli )

职    称:
研究员
职    务:
 
E-Mail:
sunyl@big.ac.cn
学科类别:
生物化学与分子生物学 生物信息学 基因组学
 
 
 
 学习经历:
  1991年9月-1995年7月 山东大学 生物学专业 理学学士
1995年9月-2000年7月 北京大学 细胞分子生物学专业 理学博士学位

 工作经历:
 

2000年8月-2002年8月 麻省理工学院 博士后

2002年9月-2010年8月 哈佛大学医学院Dana Farber癌症研究所 助理研究员和讲师

2010年9月至今 中国科学院北京基因组研究所 研究员


 主要研究领域:
 

癌症基因组和表观基因组研究

肿瘤细胞中表观遗传调控和DNA损伤修复通路的关系的研究

针对肿瘤干细胞及肿瘤细胞特异表观修饰靶点的药物设计和筛选

针对肿瘤细胞DNA损伤修复通路的药物设计和筛选

干细胞与肿瘤干细胞的基因组稳定性及表观基因组的研究


 承担科研项目情况:
 

1. 中科院战略性先导专项A类课题,基于LSD1的个性化先导化合物在三阴性乳腺癌治疗中的研究,2016/01-2017/12,在研,子课题负责人
2. 中科院重点部署项目,中国人群精准医学研究计划,恶性肿瘤的基因组演化和精准医学研究,2016/01-2018/12,项目骨干
3. 国家自然科学基金应急管理项目,Y染色体组蛋白甲基化的遗传稳定性研究,2016/01-2016/12,已结题
4. 国家重大科学研究计划,DNA复制应激相关蛋白维持基因组稳定性的机制,2013/01-2017/8,在研,参与
5. 国家重点基础研究发展计划(973),中国人前列腺癌的表观遗传特征及调控机制,2012/01-2016/8,已结题,课题负责人
6. 中科院战略性先导专项A类课题,乳腺癌干细胞分离、鉴定及特异标记物的研究及基于肿瘤干细胞特征的靶向药物研究,2012/01-2015/12,已结题,子课题负责人
7. 国家自然科学基金重大计划培育项目,组蛋白甲基化及相关的P400-Tip60染色质重塑蛋白复合体对iPS细胞重编制过程中转化率和致癌性的调控研究,2011/01-2013/12,已结题,主持
8. 国家自然科学基金主任基金,Tip60-ATM信号通路在联合免疫疾病中的作用和分子机制,2012/01-2012/12,已结题,主持


 代表论著:
 

注:#标识的为共同第一作者,*标识通讯作者或共同通讯作者
1. Han X, Wang J, Sun Y*. Circulating Tumor DNA as Biomarkers for Cancer Detection, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2017, 15(2): 59-72
2. Wang J, Chang S, Li G, Sun Y*. The application of liquid biopsy in precision medicine: opportunities and challenges, Frontiers of Medicine. 2017, doi: 10.1007/s11684-017-0526-7
3. Wang J, Han X, Sun Y*. DNA methylation signatures in circulating cell-free DNA as biomarkers for the early detection of cancer. Sci China Life Sci. 2017 Apr; 60(4):356-362.
4. Wu J#, Fu R#, Liu Z, Li G, Huang X, Xue Y, Xu Y, Sun Y *, Zhao J*, Mi J*,Cell proliferation downregulated by TGF-β2-triggered G1/S checkpoint in clinical CAFs. Cell cycle. 2017, Jan 17; 16(2):172-178.
5. Yang L, Wang YJ, Zheng LY, Jia YM, Chen YL, Chen L, Liu DG, Li XH, Guo HY, Sun YL, Tian XX*, Fang WG*. Genetic Polymorphisms of TGFB1, TGFBR1, SNAI1 and TWIST1 Are Associated with Endometrial Cancer Susceptibility in Chinese Han Women. PLoS One. 2016, 11(5): e0155270
6. Zhang M#, Wang C#, Yang C#, Meng H, Agbagwa IO, Wang LX, Wang Y, Yan S, Ren S, Sun Y, Pei G, Liu X, Liu J, Jin L*, Li H*, Sun Y*. Epigenetic Pattern on the Human Y Chromosome is Evolutionarily Conserved. PLoS One. 2016 Jan 13; 11(1):e0146402.
7. Yao L#, Ren S#, Zhang M#, Du F, Zhu Y, Yu H, Zhang C, Li X ,Yang C ,Liu H, Wang D, Meng H, Chang S, Han X, Sun Y*, Sun Y*. Identification of Specific DNA Methylation Sites on the Y-chromosome as biomarker in Prostate Cancer. Oncotarget. 2015, 6(38):40611-21.
8. Shu J#, Zhang K#, Zhang M#, Yao A, Shao S, Du F, Yang C, Chen W, Wu C, Yang W, Sun Y*, Deng H*. GATA Family Members as Inducers for Cellular Reprogramming to Pluripotency. Cell Res. 2015, 25(2):169-80.
9. Du F, Zhang M, Li X, Yang C, Meng H, Wang D, Chang S, Xu Y, Price B*, Sun Y*. Dimer monomer transition and dimer re-formation play important role for ATM cellular function during DNA repair. Biochem Biophys Res Commun. 2014, 452(4):1034-9.
10. Yao L#, Li Y#, Du F, Han X, Li X, Niu Y, Ren S*, Sun Y*. Histone H4 Lys 20 methyltransferase SET8 promotes androgen receptor-mediated transcription activation in prostate cancer. Biochem Biophys Res Commun. 2014, 450(1):692-6.
11. Du Y#, Wang J#, Jia J#, Song N#, Xiang C#, Xu J, Hou Z, Su X, Liu B, Jiang T, Zhao D, Sun Y, Shu J, Guo Q, Yin M, Sun D, Lu S*, Shi Y*, Deng H*. Human hepatocytes with drug metabolic function induced from fibroblasts by lineage reprogramming. Cell Stem Cell. 2014, 14(3):394-403.
12. Zhang M, Yang C, Liu H, Sun Y*. Induced pluripotent stem cells are sensitive to DNA damage. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2013, 11(5):320-6.
13. Xu Y, Parmar K, Du F, Price BD*, Sun Y*. The radioprotective agent WR1065 protects cells from radiation damage by regulating the activity of the Tip60 acetyltransferase. Int J Biochem Mol Biol. 2011, 2(4):295-302.
14. Ayrapetov MK, Xu C2, Sun Y2*, Zhu K, Parmar K*, D'Andrea AD, Price BD*. Activation of Hif1α by the prolylhydroxylase inhibitor dimethyoxalyglycine decreases radiosensitivity. PLoS One. 2011, 6(10):e26064.
15. Liu Z, Sun Y*. Role of Tip60 Tumor Suppressor in DNA Repair Pathway. Chinese Science Bulletin. 2011, 56 (12): 1212-5.
16. 刘志坚, 孙英丽*。癌表观遗传调控与癌症治疗。中国生物化学与分子生物学报。2011, 27(4): 310-5.
17. Xu Y, Sun Y, Jiang X, Ayrapetov MK, Moskwa P, Yang S, Weinstock DM, Price BD*. The p400 ATPase regulates nucleosome stability and chromatin ubiquitination during DNA repair. J Cell Biol. 2010, 191(1):31-43.
18. Sun Y, Jiang X, Price BD*. Tip60: connecting chromatin to DNA damage signaling. Cell Cycle. 2010, 9(5):930-6.
19. Kim K, Pollard JM, Norris AJ, McDonald JT, Sun Y, Micewicz E, Pettijohn K, Damoiseaux R, Iwamoto KS, Sayre JW, Price BD, Gatti RA, McBride WH*. High-throughput screening identifies two classes of antibiotics as radioprotectors: tetracyclines and fluoroquinolones. Clin Cancer Res. 2009, 15(23):7238-45.
20. Sun Y, Jiang X, Xu Y, Ayrapetov MK, Moreau LA, Whetstine JR, Price BD*. Histone H3 methylation links DNA damage detection to activation of the tumour suppressor Tip60. Nat Cell Biol. 2009, 11(11):1376-82.
21. Sun Y, Xu Y, Roy K, Price BD*. DNA damage-induced acetylation of lysine 3016 of ATM activates ATM kinase activity. Mol Cell Biol. 2007, 27(24):8502-9.
22. Fernandes ND, Sun Y, Price BD*. Activation of the kinase activity of ATM by retinoic acid is required for CREB-dependent differentiation of neuroblastoma cells. J Biol Chem. 2007, 282(22):16577-84.
23. Sun Y, Jiang X, Chen S, Price BD*. Inhibition of histone acetyltransferase activity by anacardic acid sensitizes tumor cells to ionizing radiation. FEBS Lett. 2006, 580(18):4353-6.
24. Jiang X#, Sun Y#, Chen S, Roy K, Price BD*. The FATC domains of PIKK proteins are functionally equivalent and participate in the Tip60-dependent activation of DNA-PKcs and ATM. J Biol Chem. 2006, 281(23):15741-6.
25. Sun Y, Jiang X, Chen S, Fernandes N, Price BD*. A role for the Tip60 histone acetyltransferase in the acetylation and activation of ATM. PNAS. 2005, 102(37):13182-7.

专利:

1. 孙英丽,于慧. 一种连续低剂量辐射富集肿瘤干细胞的方法. 2016.8.24. ZL20141 0367053.7
2. 孙英丽,王均云,常双,王冬. LSD1抑制剂用于防治三阴性乳腺癌的医药用途和药物产品. 2016.10.19. PCT/CN2016/102559
3. 孙英丽,姚鲁帅. Y染色体中特异性甲基化位点作为癌症诊断标志物的应用. 2015.12.30. PCT/CN2015/099922
4. 孙英丽,王均云,常双,王冬. ORY-1001联合放疗和化疗用于治疗人三阴性乳腺癌的用途.2015.10.19. 201510677129.0
5. 孙英丽,姚鲁帅. Y染色体中特异性甲基化位点作为癌症诊断标志物的应用. 2017.02.22. ZL 201510027708.0
6. 孙英丽,张敏杰. 利用诱导损伤结合全基因组深度测序预测细胞成瘤性新方法. 2015.1.23. 201510037304.X
7. Brendan D. Price, Yingli Sun. Prolyl hydroxylase inhibitors as radiation mitigators and radiation protectors. 2012.3.22. WO 2012/037212 A1

专著:

1. Sergei Kozlov, Yingli Sun, et al. ATM kinase. Springer, 2017.5
2. 许智宏,孙英丽等,《中国大百科全书》(生物学学科第三版词条). 百科全书出版社
3. 孙颖浩,孙英丽等, 《泌尿系统肿瘤个体化精准诊治》.科学出版社 (待出版)


 社会任职:
  Genomics, Proteomics &Bioinformatics 编委
Scholarena Journal of Genetics 编委
International Journal of Genomics, Proteomics, Metabolomics & Bioinformatics (IJGPMB) 编委
Journal of Clinical Trials in Oncology 编委
北京细胞生物学学会第三届理事会 理事
北京细胞生物学会青年学术委员会 委员
北京细胞生物学学会第四届理事会 理事
安徽省药学会精准药物治疗专业委员会 副主任委员

 获奖及荣誉:
 

1999年 谈家桢基金生命科学九源奖学金(一等奖)

2000年 北京大学科技发明“挑战杯”二等奖

2000年 北京大学“学术十杰”

2000年 北京大学优秀博士论文(一等奖)

2002年 全国优秀博士论文

2005年 教育部自然科学奖 (一等奖,主要完成人)

2007年 美国癌症协会(AACR)Scholar in training award

2009年 美国癌症协会(AACR)Scholar in training award

2006-2008年 Ruth L. Kirschstein National Research Service Award (NRSA,T32), NIH

2010年 哈佛大学首届华人生命科学年会杰出研究奖 (Harvard Chinese Life Science Annual Distinguished Research Award)

2010年 第二届“SCOPUS寻找青年科学之星”成长奖(生命科学领域第二名)